Seit Ende der 1960er Jahre werden in Deutschland in fast allen international und national bedeutenden Feuchtgebieten sowie in vielen lokal oder regional bedeutenden Gewässern Rastvogelerfassungen
durchgeführt. So wird auch am Ammersee und am Starnberger See gezählt. Seit 2016 finden im Landkreis Starnberg auch Wasservogelzählungen am Maisinger See, Wörthsee, Pilsensee und Weßlinger See
statt. Derzeit beteiligen sich deutschlandweit über 2.000 Zählerinnen und Zähler an den Erfassungen. Die Wasservogelzählung ist damit das älteste und umfangreichste Vogelmonitoringprogramm
bundesweit. Nähere Informationen zur Internationalen Wasservogelzählung in Deutschland findet man unter diesem Link.
In Bayern wird die Wasservogelzählung von der Staatlichen Vogelschutzwarte beim Landesamt für Umwelt koordiniert.